Participants:
Lydia Yahia Cherif (Unlicensed)
Support de présentation
Point abordés
GitHub
utilisation de mon compte GitHub perso, il serait préférable d’utiliser le Gitlab de l’ICM
voir avec Franco et Soichi si possible de donner un lien Gitlab pour une App
sinon lier le dépôts Gitlab au dépôt GitHub de Brainlife
app-temporal-filtering
enlever le resampling (faire une app à part pour ça)
doit pouvoir s’appliquer aussi bien sur des données continues qu'épochées (de préférence ce doit être transparent pour l’utilisateur, si pas possible lui demander quel genre de données il donne en entrée)
pouvoir appliquer plusieurs fois cette app (effectuer un notch après un passe-bas par exemple…)
Rapport html
mettre les informations liées au fichier traité en haut du rapport
rappeler les paramètres de configuration (listés dans le
config.json, ne pas forcément tous les préciser)pour rapport de l’app-bad-channels: faire un spectre pour les flat channels + good channels et un autre pour les noisy channels + good et un spectre avec seulement les bons canaux
Afficher les spectres avant après à droite et à gauche respectivement pour plus de lisibilité
peut-être ne pas garder les représentations dans le domaine temporel
app-create-events
créer une application qui créé des événements, son output serait la matrice d'évènements
cette matrice serait stockée dans un .tsv (à ajouter au datatype meg/fif)
app-make-epochs
à partir des events crées par app-create-events
ou à partir des events déjà présents dans le fichier
app-apply-ICA
doit pouvoir s’appliquer aussi bien à des données continues que discontinues
app-channel-types
sélectionne les types de canaux (magnétomètres, gradiomètres, EEG….)
renomme les canaux si besoin (à partir d’un montage par ex), en utilisant des regexp
pratique quand on a besoin d’homogénéiser des datasets
format des données
à l’issue de certaines apps, les données pourraient être ré-écrites dans plusieurs formats (par exemple après le resampling)
Passer à l’EEG
certaines apps sont compatibles avec l’EEG (comme apply-ICA, app-temporal-filtering, …)
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