Compatibilité
Versions de MNE : on en choisit une et on s’y tient pour l’instant.
Au , la version 0.22.0 est utilisée.
Le container brainlife/mne:0.22.0 contient les librairies Python suivantes :
mne
0.22.2,numpy
1.20.0,scipy
1.6.0,matplotlib
3.3.4,scikit-learn
0.24.1,pandas
1.2.1,seaborn
0.11.1
Paramètres fonctions
Concernant les compatibilités / versions MNE (sur paramètres fcts et sur format fichiers lus/écrits)
Structuration des datatypes
Les datatypes servent essentiellement à échanger des informations/data entre apps. Ces échanges se font principalement entre étapes successives de pipelines de traitement. Nous souhaitons à terme proposer une utilisation flexible de plusieurs toolboxes (MNE, FT, BST…). Par expérience, nous savons que les transitions entre toolboxes sont compliquées. Il conviendra donc de se concentrer sur un certain nombre de transitions clés.
Puisque nous démarrons avec MNE, regardons comment se présente le typical MEEG workflow dans MNE :
...
Les datatypes sont en bleu (MEG) et rouge (MRI) ici. Sauf “Source estimate”, qu’on pourrait aussi passer dans un datatype séparé.Résumés des discussions internes sur le projet.
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