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MaxFilter interpole les mauvais canaux donc à la sortie de cette fonction raw.info['bads']
est vide. Mais il est conseillé de vérifier à nouveau les canaux à l’issue de MaxFilter et donc de mettre à jour le raw.info['bads']
(car c’est ce qui est pris en compte dans les fonctions MNE comme on va le voit voir par la suite) et le channels.tsv
.
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Ainsi, si on veut par exemple appliquer un notch en gardant le paramètre picks='all'
, tous les canaux vont être sélectionnés sauf ceux qui sont marqués comme bad dans le raw.info['bads']
, or si ce champ n’a pas été mis à jour, on va sélectionner aussi les mauvais canaux identifiés après MaxFilter.
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Contacter Richard à ce sujet ?
Informations mauvais canaux dans en accord avec BIDS
Dans BIDS, les mauvais canaux sont listés dans le fichier channels.tsv
: la colonne status précise si ce canal est mauvais (voir https://bids-specification.readthedocs.io/en/stable/04-modality-specific-files/02-magnetoencephalography.html#channels-description-_channelstsv).